O processo é basicamente o mesmo para todas as atualizações independente da versão:
- Fazer o backup dos arquivos: config.php e admin/config.php;
- Enviar os arquivos da nova versão para o servidor (sem os configs, mantendo os da lojas em funcionamento);
- http://www.link_da_loja.com.br/install;
- Seguir os passos normalmente para instalação;
- Como as versões são diferentes, possivelmente terá que enviar a tradução respectiva à última versão;
- Não utilize a versão 2.0.3.0, use a versão 2.0.3.1 que está mais estável;
- Antes de executar esses passo é aconselhável que faça o BACKUP completo de sua loja, arquivos e banco de dados.
No link abaixo tem o que expliquei acima mais detalhado:
https://www.opencartbrasil.com.br/tutori ... o-opencart
Boa sorte.